Orgány fondu jsou správa fondu a předseda správy fondu.
Pravidelným správním orgánem fondu jest správa fondu. Usnesení její, pokud jsou všeobecného nebo zásadního rázu po stránce hospodářské, organisační nebo finanční, musí býti schválena ministrem zemědělství.
Vyřizování běžných záležitostí v mezích zmíněných usnesení rázu všeobecného nebo zásadního může správa fondu svěřiti předsedovi správy za jeho osobní odpovědnosti.
O věcech naléhavých, při nichž nelze bez ohrožení zájmů fondu vyčkati usnesení správy fondu, může za své odpovědnosti a se schválením ministra zemědělství rozhodovati a je vyřizovati předseda správy fondu; o věcech takto vyřízených podá předseda správě fondu v nejbližší její schůzi zprávu. Předsedovi náleží mimo to přímo vedení prací fondu dle zásad vytčených správou fondu; předseda provádí všecka usnesení správy, dozírá přímo na kancelář fondu a podává o působnosti fondu pravidelné zprávy ve schůzích správy fondu.
Předseda může výkon usnesení správy fondu, které dle jeho přesvědčení není v souhlasu s platnými předpisy právními nebo se zájmy fondu, odložiti až do rozhodnutí ministra zemědělství.
Zajde-li předsedu nějaká překážka, přechází výkon jeho funkcí na jeho náměstka.