Na vysoké školy vojenské se vztahují ustanovení zákona č. 58/1950 Sb., o vysokých školách, ve znění zákona č. 46/1956 Sb., s výjimkou § § 3, 4, 6, 10, 13, § 15 odst․ 3, § 16 odst. 4 až 7, § 17 odst. 2, § 19 odst. 1 a 5, § 26 odst. 2 věty druhé a § § 31 až 34. Ustanovení § 5 odst. 2 písm. d) se vztahuje pouze na vědní obory obdobné vědním oborům na civilních vysokých školách; jinak vykonává působnost Státního výboru pro vysoké školy a Slovenského výboru pro vysoké školy na úseku vysokých škol vojenských orgán zřízený ministrem národní obrany.

Působnost, která přísluší podle zákona o vysokých školách ministru (ministerstvu) školství a kultury, vykonává na úseku vysokých škol vojenských v rozsahu stanoveném v odstavci 1 ministr (ministerstvo) národní obrany.

Vyžaduje-li toho jednotná úprava otázek obecné povahy, a při jmenování a ustanovování profesorů a docentů vysokých škol vojenských a ustanovování jejich zástupců pro vědní obory obdobné vědním oborům na civilních vysokých školách postupuje ministr národní obrany v dohodě s ministrem školství a kultury.

Návrhy na jmenování profesorů vysokých škol vojenských podává vládě ministr národní obrany.

Vedoucí kateder vysokých škol vojenských jmenuje ministr národní obrany.

Označení pracovníků vysokých škol ( § 25 zákona), kromě označení profesorů, docentů a odborných asistentů, může u vysokých škol vojenských upravit ministerstvo národní obrany odchylně.

Úkoly, organisaci a způsob správy jednotlivých vysokých škol vojenských stanoví jejich organisační statuty vydané ministrem národní obrany.